City Hunter 3 est la suite de City Hunter 2. On suit toujours les aventures de Ryô Saeba alias City Hunter, tueur à gages professionnel toujours au secours d'une belle jeune femme en difficulté et de Kaori Makimura, partenaire de Ryô. Cette dernière fait en sorte que Ryô ne fasse pas de bêtises avec ses clientes.
